El Macuiltépec es un pequeño volcán monogenético con una forma cónica y
una pendiente fuerte (20 a 30 grados). Su origen data del Pleistoceno Superior, extinguido hace 30 000 años antes del presente, y del Holoceno. El cono volcánico está cubierto por material escoriáceo andesítico o basáltico, a veces cubierto por cenizas volcánicas.
La vegetación arbustiva es "chapeada" constantemente en las áreas
donde la "hierba" crece demasiado. En dichas áreas florecen infinidad de
plantas silvestres con flores de múltiples y apreciables coloridos. Se
calcula que aualmente florecen unas 45 especies de flores arbustivas
llamativas (inclusive algunos visitantes las cosechan eventualmente).
Algunas de tales flores como la dalia cimarrona (especie desconocida que
florea a finales de Verano) son cruciales para numerosas especies de
mariposas (al menos 15 morfoespecies). La balsamina (Impatiens sp.)
es otra de las especies naturalizadas en el PEM que agregan un elemento
estético al bosque con sus diversos colores de flores. Entre las
frutales sembradas predominan el aguacate (Persea americana), la naranja (Citrus sinensis), la guayaba (Psidium spp.) y el níspero (Eryobotria japonica), que se ha naturalizado profusamente.
Entre las más comunes especies de ornato destacan: el tulipán africano (Spathodea campanulata), el hule (Ficus elastica), la jacaranda (¿¿Jacaranda mimosifolia), el nogal (Juglans piriformis), el trueno (Ligustrum lucidum), la liliana (Syzygium samaranguensis), la maicera (Dracaena flagrans), el warneke (D. deremensis), el coleo (Coleus blumei), (Cassia didymobotria), bugambílea (Buganvillea glabra), hortensia (Hydrangea macrophylla), el helecho peine (Nephrolepsis exaltata), y el bambú (Phyllostachys aurea). Las plantas parásitas están representadas comúnmente por la corrigüela (Psittacanthus schiedeanus) en el estrato arbóreo y por la longanicilla (Cuscuta xalapensis). Entre los hongos poliporáceos más comunes se encuentran Pleurotus ostreatus, Auricularia spp) y Polyporus sanguíneus entre otros.
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